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微生物安全实验室必须保证人身安全、环境安全、废弃物安全和样本安全，能长期而安全的运行，同时还为需要实验室工作人员提供一个舒适，而良好的工作环境。

灭菌室
灭菌室主要用于培养基的灭菌和各种器具的灭菌，室内应备有高压蒸汽灭菌器、烘箱等灭菌设备及设施。

在微生物中，菌种的接种移植是一项主要操作，这项操作的特点就是要保证菌种纯种，防止杂菌的污染。在一般环境的空气中，由于存在许多尘埃和杂菌，很易造成污染，对接种工作干扰很大。

通常情况下洁净工作服至少每周洗涤一次，有些要求高的工种甚至每天洗涤一次（根据验证进行）。在普通的房间中清洗时，会附着灰尘和，以及受洗净剂的污染。另外，在捆包和搬运过程中，也会有附着灰尘及微生物的危险。因此，需要特别建立洁净工作服清洗消毒操作规程和要求，注意事项等，一般包含以下内容（可能部分步骤各个公司会有所不同，根据各自经验验证的流程进行）：
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